Com o sucesso de Phantasy Star Online, a SEGA resolveu continuar a saga com um novo título, Phantasy Star Universe. O game foi lançado primeiro para Playstation2 (PS2) e PC em 31 de Agosto 2006 (Japao). Teve sua versão para Xbox 360 dois meses depois.

Aproveitando a nova tecnologia fornecida pelos consoles e PCs atuais, os graficos melhoraram muito e o modo de jogo foi aprimorado.

Phantasy Star Universe não é uma continuação de PSO ou mesmo de algum Phantasy Star da série clássica. Ele possui elementos da série porém se passa em um local e tempo diferente dos anteriores.

Assim como seu antecessor (PSO), PSU também ganhou alguns prêmios:

• IGN: “Melhor RPG do PS2 na E3”
• 1UP: “Melhor jogo de RPG na E3”
• G4: “Melhor jogo multi-plataforma na E3”